甲方可以指定审计机构吗？

甲方可以指定审计机构。

工程竣工决算审计，可以说是甲方审乙方。无论是总包还分包，都是甲方选定审计单位审计。

审计单位差不多是一个甲方的代表。但审计单位并不能说成为了帮甲方，只能说是为了他们自己的利益去审某一项工程。因为审计单位从核减或核增的金额乘以一个规定系数作为收入。所以，审计单位只能依法依规审计。